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全部共 21 篇

合成生物学综述Molecular cell

AI empowers scalable and programmable RNA design.

Ziqian Lin、Han Huang、Jiuming Wang 等DOI: 10.1016/j.molcel.2026.09.025

综述

0 次引用趋势数据不足

人工智能推动可扩展、可编程的RNA设计。功能性RNA设计是合成生物学与RNA疗法的核心。近年来的AI进展利用三级结构解读功能并指导序列生成，取代传统的试错流程。由AI模型辅助的实验方法不断扩展结构数据基础，最终实现可扩展、可编程的RNA设计。

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编辑短评

摘要指出AI利用三级结构解读RNA功能并指导序列生成，替代传统试错流程。其核心逻辑是AI辅助实验方法持续扩展结构数据基础，进而支撑可扩展、可编程的RNA设计。但摘要未报告具体模型、数据集或实验验证结果，所述“赋能”仍属方向性论断，需后续实证研究检验其可扩展性与可编程性的实际效果。

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完整作者

Ziqian Lin、Han Huang、Jiuming Wang、Liang Hong、Irwin King、Yu Li

作者机构

Department of Computer Science and Engineering, The Chinese University of Hong Kong, Sha Tin, Hong Kong SAR 999077, China.
Department of Computer Science and Engineering, The Chinese University of Hong Kong, Sha Tin, Hong Kong SAR 999077, China. Electronic address: liyu@cse.cuhk.edu.hk.

技术路线

结构数据（由AI辅助实验方法持续扩展）→ AI模型利用三级结构解读功能并指导序列生成

最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 05:59

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临床队列综述Frontiers in medicine

Leveraging large language models to generate multiple-choice questions for epilepsy education.

作者信息暂未整理DOI: 10.3389/fmed.2026.1978708

综述

0 次引用趋势数据不足

大型语言模型（LLMs）越来越多用于生成医学评估题目，但其在疾病特异性题目编写中的可靠性仍不确定。本研究在标准化蓝图下对七种LLMs生成癫痫最佳单选题进行基准测试，聚焦结构合规性、临床准确性、专家评分质量和教育可用性。每种模型完成相同的60项预设任务，涵盖基础知识、临床病例、治疗决策、诊断评估和纵向管理，共生成420道题。任务通过相同的单轮提示交付，未进行模型特定优化、网络搜索或使用外部工具。客观评估考察结构合规性、答案准确性、文本特征和响应时间，两名盲法临床评审独立按五分制对内容严谨性、清晰度、干扰项质量、教育实用性、认知对齐和整体可用性评分。结果：经一次标准化纠正提示后，全部420道题均满足结构要求，但首次通过合规率为83.33%至100%。答案准确性差异显著，为61.67%至98.33%，Claude-5最高。GPT-5.6获得最高综合专家评分（中位数3.75），其次为Claude-5（3.67）和Kimi-K3（3.50）。干扰项质量是常见局限，各模型中位数仅2-3分。420道题中仅2道（0.48%）无需修改即可直接使用，均由GPT-5.6生成；119道（28.33%）小幅修改后可用，299道（71.19%）需大幅修改。较长输出与更好的认知对齐相关，但与内容严谨性或清晰度无关；响应时间与整体可用性无关。结论：当代LLMs能可靠复现癫痫多选题的结构，但结构合规性和答案准确性并不保证教育就绪性。模型优势是多维的，干扰项构建薄弱仍是直接使用的主要障碍。LLMs可支持专家监督下的题目起草，但在医学教育部署前仍需独立临床审查和后续基于学习者的心理测量学验证。

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技术路线

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最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/11/01 01:32

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临床队列综述Frontiers in medicine

Predictors and prescribing patterns of definite anticholinergic medication use among community-dwelling older adults in Saudi Arabia: a retrospective multicenter cross-sectional study.

作者信息暂未整理DOI: 10.3389/fmed.2026.1974639

帕金森病成人老年多中心横断面研究

0 次引用趋势数据不足

沙特阿拉伯社区老年人确定性抗胆碱能药物使用的预测因素及处方模式：一项回顾性多中心横断面研究。目的：抗胆碱能药物与老年人认知障碍和跌倒相关，但沙特阿拉伯的多中心证据仍有限。本研究描述接受门诊治疗的老年人确定性抗胆碱能负担的处方模式及相关因素。方法：回顾性多中心横断面研究，使用沙特阿拉伯Al Khobar和Al-Ahsa两家三级医院2019—2024年门诊记录和配药数据，纳入60岁及以上、至少使用一种抗胆碱能认知负担（ACB）量表评分为2或3的药物的成人。采用稳健线性回归、负二项回归和logistic回归模型分析确定性ACB评分、额外合格药物及多药使用。结果：纳入1,664名老年人，共2016例患者-药物记录。84.3%存在多药使用，17.5%使用多种合格药物。膀胱抗毒蕈碱药、抗精神病药和三环类抗抑郁药占药物记录的78.1%，泌尿科、精神科和神经科占72.0%。20.0%的可评估记录存在相应编码诊断。多药使用、高血压、抑郁、帕金森病、精神分裂症和双相障碍与全部三项结局独立相关；精神分裂症关联最强：确定性ACB评分（B=2.206；95%CI 0.429~3.982）、额外药物（IRR=4.395；95%CI 2.499~7.732）、多药使用（aOR=8.303；95%CI 3.275~21.055）。结论：确定性抗胆碱能药物使用集中于少数药物类别和处方专科，精神疾病和多药使用与更高负担持续相关。

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最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/11/01 01:32

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AI 靶点发现综述Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics

Immunosenescence as a modifiable driver of neurodegenerative diseases: Pathways and multidimensional emerging strategies for Alzheimer's and Parkinson's diseases.

Jingyu Zhao、Linzhuo Qu、Hongjian Guan 等DOI: 10.1016/j.neurot.2026.e01096

阿尔茨海默病帕金森病综述

0 次引用趋势数据不足

免疫衰老是阿尔茨海默病（AD）和帕金森病（PD）的核心上游驱动因素，通过四条机制相互关联的级联通路发挥病理作用：衰老相关分泌表型（SASP）介导的慢性炎症失衡、免疫代谢重编程引起的氧化应激、自噬-溶酶体功能障碍导致的蛋白稳态异常，以及中枢神经系统免疫特权破坏所致的神经-免疫交流紊乱。当前临床实践仍主要局限于基于神经递质的对症管理，既无法阻止上游病理进展，也不能恢复丢失的神经元群体。靶向免疫衰老的新兴干预策略包括衰老细胞清除剂、抗氧化与代谢调节剂、自噬恢复及精准靶向纳米载体递送，在临床前和早期临床研究中已显示出延缓疾病进展的能力，其作用机制涉及选择性清除衰老免疫细胞、重塑神经炎症微环境和恢复细胞质量控制。多维治疗策略从人工智能引导的靶点发现、纳米载体工程和肠道菌群干预等角度，同时作用于免疫衰老网络的多个节点，以克服单靶点策略的固有局限。本文综述现有机制证据和转化数据，确立免疫衰老作为可干预治疗靶点，并为AD和PD的精准疾病修饰治疗提供概念框架。

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AI 辅助短评，基于标题和摘要整理

该文将免疫衰老确立为AD与PD的核心上游驱动因素，整合四条相互关联的病理级联，并梳理靶向免疫衰老的干预策略与多维治疗框架。其价值在于把机制证据与转化数据统一到可干预靶点的概念体系中，为精准疾病修饰治疗提供思路，但属综述性论述，尚需实证检验。

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Jingyu Zhao、Linzhuo Qu、Hongjian Guan、Huiying Che、Fei Shi、Yang Yang

作者机构

Central Laboratory, the Affiliated Hospital of Yanbian University(Yanbian Hospital), Yanji, 133000, PR China; Key Laboratory of Pathobiology, Yanbian University, Yanji, 133000, PR China.
Department of Neurology, Jilin City Central Hospital, Jilin, 132001, PR China. Electronic address: 405700019@qq.com.
Central Laboratory, the Affiliated Hospital of Yanbian University(Yanbian Hospital), Yanji, 133000, PR China; Key Laboratory of Pathobiology, Yanbian University, Yanji, 133000, PR China. Electronic address: yangyang@ybu.edu.cn.

技术路线

文献综述：汇总机制证据与转化研究数据（SASP炎症失衡、免疫代谢重编程氧化应激、自噬-溶酶体功能障碍、神经免疫交互破坏）→ 提出以免疫衰老为可干预靶点的多维策略（衰老细胞清除剂、抗氧化与代谢调节、自噬恢复、纳米载体递送、AI靶点发现、肠道菌群干预）

最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 06:05

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临床队列综述Laboratory medicine

Extending the clinical utility of exome sequencing: reanalysis, variant reclassification, and dynamic reporting in molecular diagnosis.

Lupeng Ji、Xue Zhou、Jiong Gao 等DOI: 10.1093/labmed/lmag081

罕见病多组学综述

暂无引用数据

临床外显子组测序（ES）广泛用于疑似孟德尔病和罕见病的诊断，但许多患者初次分析后仍无法确诊，阴性或非诊断性结果并不一定排除遗传病因，因为基因组知识和患者表型会随时间演变。该叙述性综述检索PubMed/MEDLINE、Web of Science核心合集和Google Scholar，综合外显子再分析、变异重分类、动态报告及补充诊断方法的证据与实践考量。非诊断性ES结果可能反映技术和生物信息学局限、临床或家系信息不完整、基因-疾病知识演变、变异证据不确定或超出常规ES检测范围的遗传机制。结合更新表型信息、数据库、分析方法和家系证据的结构化再分析可发现额外诊断；变异重分类和动态报告更新支持纵向解读，次要发现和人工智能辅助流程需适当监管。再分析不足时，可机制导向升级至基因组测序、RNA测序、长读长测序、甲基化检测、生化检测或功能试验。结构化再分析和动态报告可将ES从一次性分子检测转变为纵向诊断过程，实施需透明的再分析标准、可追溯的解读、不确定性的适当沟通和可持续的实验室流程，以支持临床决策和精准医学。

为什么值得关注

AI 辅助短评，基于标题和摘要整理

本文为叙述性综述，系统梳理外显子组测序阴性后重分析、变异重分类与动态报告的策略，并讨论机制导向的升级检测。选题切合临床痛点，强调将ES从一次性检测转变为纵向诊断过程。但作为综述，未提供原始验证数据，重分析与动态报告的实际增益、可操作性及成本效益仍需前瞻性研究确认。

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完整作者

Lupeng Ji、Xue Zhou、Jiong Gao、Lin Zhu、Hui Zhang、Yilong Tu、Shun Ge、Chao Yuan

作者机构

Department of Pathology, The Second Affiliated Hospital of Jiaxing University, Jiaxing, China.
Medical Affairs Department, Hangzhou Adicon Clinical Laboratories Co., Ltd., West Lake District, Hangzhou, China.
Medical Affairs Department, Shenzhen Mindray Bio-Medical Electronics Co, Ltd, Shenzhen, China.

技术路线

文献检索（PubMed/MEDLINE、Web of Science Core Collection、Google Scholar）→叙述性综述证据综合（外显子组重分析、变异重分类、动态报告及补充诊断方法）

最近 5 个完整年度引用趋势

暂无引用数据

数据来源：暂未标注更新时间：暂无更新时间

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合成生物学综述Current issues in molecular biology

Plant Molecular Farming for Cancer Immunotherapy: Production, Glycoengineering, and Structural Insights into Therapeutic Monoclonal Antibodies.

Maria Concepción Tamayo-Ordoñez、María José García-Castillo、Francisco Alberto Tamayo-Ordoñez 等DOI: 10.3390/cimb48101028

肿瘤与癌症综述

0 次引用趋势数据不足

癌症是全球主要死因之一，亟需创新、可扩展且经济的治疗策略。单克隆抗体通过特异性靶向肿瘤相关抗原和免疫检查点通路革新了肿瘤治疗，但传统哺乳动物细胞生产成本高、基础设施要求大。植物分子生物工程作为重组生物制药的替代平台，具有快速扩增、低成本、生物安全和表达系统灵活等优势。本文综述植物源抗癌生物制品的最新进展，重点介绍靶向HER2、PD-1和PD-L1的治疗性单克隆抗体和免疫检查点抑制剂，这些植物源抗体在结构完整性、抗原结合能力和生物活性方面与哺乳动物源抗体相当。研究以实验测定的抗体结构为参考，对曲妥珠单抗和帕博利珠单抗进行计算机结构比较分析，并模拟植物相关Fc糖型，重点关注Fc N-糖基化及聚糖溶剂可及性。合成生物学、精准糖工程和受控培养技术的进步，凸显植物生物工厂作为下一代可负担、全球可及癌症免疫治疗平台的潜力。

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完整作者

Maria Concepción Tamayo-Ordoñez、María José García-Castillo、Francisco Alberto Tamayo-Ordoñez、Víctor de Jesús Suárez-Valencia、Atl Víctor Córdova-Quiroz、Víctor Hugo Ramos-García、Benjamín Abraham Ayil-Gutiérrez、Angel Virgilio Domínguez-May、Sara Luz Nahuat-Dzib、Juan Carlos Robles-Heredia、Marta Guadalupe Lizama-Gasca、Daniel Lozano-Venegas、Víctor Manuel Velasco-Rodríguez、Esmeralda Cazares-Sánchez、Grethel Díaz-Palafox、Yahaira de Jesús Tamayo-Ordoñez

作者机构

Facultad de Ciencias Químicas, Universidad Autónoma de Coahuila, Saltillo 25280, Mexico.
Unidad de Biotecnología, Centro de Investigación Científica de Yucatán A.C., Mérida 97200, Mexico.
Facultad de Química, Universidad Autónoma del Carmen, Ciudad del Carmen 24180, Mexico.
Facultad de Medicina, Universidad Autónoma de Coahuila, Saltillo 25280, Mexico.
Unidad Académica Multidisciplinaria Reynosa-Aztlán, Universidad Autónoma de Tamaulipas, Reynosa 88740, Mexico.
SECIHTI, Centro de Biotecnología Genómica, Instituto Politécnico Nacional, Reynosa 88710, Mexico.
TecNM-Instituto Tecnológico Superior del Sur del Estado de Yucatán, Oxkutzcab 97880, Mexico.
Departamento de Ingeniería Química y Bioquímica, Campus Mérida, Tecnológico Nacional de México, Mérida 97118, Mexico.
Facultad de Enfermería y Nutrición U.L., Universidad Autónoma de Coahuila, Torreón 27298, Mexico.
Instituto Tecnológico de la Zona Maya, Tecnológico Nacional de México, Chetumal 77960, Mexico.

技术路线

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最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 07:00

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合成生物学综述Microorganisms

Synthetic Biology and Systems Metabolic Engineering of Aminoglycoside Antibiotics: From Biosynthetic Pathways to Resistance-Evading and Low-Toxicity Design.

Shan Chu、Yuqing Chu、Mohan Huang 等DOI: 10.3390/microorganisms14102209

综述

0 次引用趋势数据不足

氨基糖苷类抗生素是临床治疗革兰阴性菌感染的重要药物，但耐药性传播及耳毒性、肾毒性等剂量限制性副作用严重制约其临床应用。合成生物学与系统代谢工程的发展为解析和改造其生物合成途径提供了有力手段。本文系统总结氨基糖苷类抗生素的保守生物合成逻辑，重点阐述2-脱氧链霉胺和链霉胍核心骨架的组装，以及糖基转移酶、磷酸吡哆醛依赖型氨基转移酶、S-腺苷-L-甲硫氨酸依赖型甲基转移酶和磷酸化/脱氨酶四类主要酶的催化特征与底物选择性。在此基础上，从基因线路设计、底盘细胞优化、无细胞合成、异源从头生物合成和系统生物学驱动的全局优化五个方面综述其合成生物学与系统代谢工程核心策略。以庆大霉素、卡那霉素、妥布霉素、阿普拉霉素、新霉素和链霉素为代表，分析各生物合成途径特点及合成生物学开发潜力，重点关注新型衍生物研发，包括普拉佐米星等规避耐药性衍生物、基于4-单取代阿普拉霉素结构的低毒性设计及组合生物合成杂合抗生素进展。最后探讨异源表达兼容性、产物产量瓶颈和构效关系认识不足等关键挑战及应对策略。

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完整作者

Shan Chu、Yuqing Chu、Mohan Huang、Haoran Lu、Zhiqiao Liu、Shuo Wang、Hongquan Zhao、Xiaotang Chen

作者机构

College of Medical Engineering, Jining Medical University, Jining 272067, China.

技术路线

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最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 06:24

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AI 靶点发现综述Frontiers in oncology

Colorectal cancer organoids: a developmental trajectory from Matrigel embedding to AI-empowered precision medicine.

作者信息暂未整理DOI: 10.3389/fonc.2026.1901112

肿瘤与癌症综述

0 次引用趋势数据不足

结直肠癌的高度异质性与复杂微环境是治疗耐药和临床转化失败的关键瓶颈，类器官技术的迭代发展为精准肿瘤学提供重要驱动力。本文系统梳理结直肠癌类器官技术的四阶段发展轨迹，并指出各阶段并非严格依次替代，而是长期共存、互补。第一代Matrigel包埋法奠定三维培养基础，但微环境模拟不足；第二代通过优化培养基和共培养体系实现初步肿瘤-基质相互作用；第三代整合微流控芯片和生物打印等工程技术，突破专用平台在高通量标准化和动态调控方面的瓶颈；第四代借助人工智能，在智能表型分析、药物反应预测及数字孪生系统初步探索方面取得实质进展。通过比较四代技术在异质性保留、通量、临床潜力和成本效益方面的差异，强调其在个体化用药指导和新靶点发现中的核心临床价值。尽管仍面临微环境模拟不足、人工智能可解释性差和缺乏标准化等挑战，现有证据表明，跨学科整合与智能平台开发可推动类器官技术成为连接基础研究与临床实践的关键枢纽。建议加快建立标准化类器官生物样本库，将人工智能驱动的预测模型嵌入临床工作流程，并制定监管框架，以促进结直肠癌类器官精准医学转化。

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最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 06:05

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临床队列综述Briefings in bioinformatics

Advances in computational biology approaches for digital modeling of tumor microenvironment.

作者信息暂未整理DOI: 10.1093/bib/bbag595

肿瘤与癌症机器学习综述

0 次引用趋势数据不足

肿瘤微环境（TME）是异质性多尺度系统，仅靠实验难以完整刻画。计算建模可整合细胞、血管、代谢、免疫与力学机制，但方法多样，给模型选择、参数化、验证和临床转化带来困难。本文以问题为导向综述TME建模的计算方法，比较连续、离散及离散-连续混合范式在生物学分辨率、数据需求、可解释性和计算成本上的差异，并将其关联至肿瘤细胞动力学、血管运输、细胞外基质与力学、代谢与缺氧、免疫互作五个机制领域；从参数可识别性、不确定性量化、数值有效性、生物学保真度和临床相关性考察模型可信度，强调按预期用途和验证情境解读性能。文章还分析机器学习在机制-ML整合中的功能，包括代理模型加速前向模拟、反演方法估计潜参数与状态、患者特异性工作流整合多模态临床数据与机制模型，以及物理信息神经网络嵌入控制方程；并讨论纵向个性化、物理感知多尺度整合、临床可部署数字孪生、外部泛化和合成数据到临床迁移，提出从机制假设生成到自适应数字孪生决策支持的转化就绪路径。可信的TME建模应优先采用最小充分模型，明确预期用途，透明呈现不确定性，并使证据与生物学或临床问题相匹配。

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最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/11/01 03:57

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合成生物学综述Molecular cancer

Trace elements and tumors: homeostatic networks, molecular mechanisms and new horizons for precision intervention.

Shengxin Zhang、Keqin Tan、Qin Zhang 等DOI: 10.1186/s12943-026-02754-y

肿瘤与癌症综述

0 次引用趋势数据不足

痕量元素铁、铜、锌、硒、锰是生命必需物质，作为酶辅因子、结构组分和信号分子参与能量代谢、氧化还原平衡及基因组稳定性调控，其生理功能呈剂量-效应双相性，稳态失衡既可维护健康也可促进恶性转化。本综述系统阐述上述五种核心痕量元素在生理条件下的完整生命周期及其功能互联，并阐释肿瘤细胞通过元素成瘾机制劫持该调控网络。文章详述铁依赖性铁死亡与铜依赖性铜死亡的新兴作用，以及痕量元素对凋亡和自噬的情境依赖性调控，揭示肿瘤特异性代谢脆弱性。在肿瘤免疫微环境中，锌和硒通常支持抗肿瘤免疫，铁和铜失调驱动免疫抑制极化，锰则为具免疫治疗潜力的cGAS-STING激动剂。在血管生成与转移方面，铜和铁在细胞外基质重塑、上皮-间质转化及血管生成信号中发挥核心作用。临床证据表明，全身及局部元素失衡可作为多种癌症的风险生物标志物。治疗策略包括传统营养与药理干预、基于元素代谢的放化疗及免疫治疗协同增敏，以及元素响应纳米平台和合成生物学工程免疫细胞等交叉工程方法。多数治疗证据来自临床前模型，需严谨基础研究支撑临床转化。

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AI 辅助短评，基于标题和摘要整理

本文系统梳理铁、铜、锌、硒、锰的稳态网络与肿瘤代谢劫持机制，涵盖铁死亡、铜死亡及免疫微环境调控，并整合元素失衡作为风险标志物的临床证据。治疗策略分类清晰，但作者明确多数证据源于临床前模型，转化前需严谨基础研究。综述框架具系统生物学视角，知识缺口梳理有助于假设驱动探索，适合作为该领域参考。

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Shengxin Zhang、Keqin Tan、Qin Zhang、Yuzhe Zhao、Ziyang Cheng、Xinggang Yang、Jingsi Dong、Jiaming Liu、Xuelei Ma

作者机构

Department of Biotherapy, Cancer Center and State Key Laboratory of Biotherapy, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China.
Department of Postgraduate Students, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China.
West China Hospital of Stomatology, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China.
Department of Hematology, Children's Hospital of Soochow University, Suzhou, Jiangsu, China.
Department of Respiratory and Critical Care Medicine, Institute of Respiratory Health, Frontiers Science Center for Disease-Related Molecular Network, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, China.
Lung Cancer Center/Lung Cancer Institute, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China. dongjingsi@wchscu.edu.cn.
Department of Thoracic Surgery, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China. dongjingsi@wchscu.edu.cn.
Department of Urology, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, China. JM3099@163.com.
Department of Biotherapy, Cancer Center and State Key Laboratory of Biotherapy, West China Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China. maxuelei0726@wchscu.cn.

技术路线

文献综述：整合基础与临床数据 → 归纳五种微量元素（铁、铜、锌、硒、锰）的稳态网络、分子机制及肿瘤特异性代谢脆弱性

最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/10/29 03:49

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