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公共数据库临床研究Journal of diabetes and metabolic disorders

Non-linear association between average daily sleep duration and cardiovascular disease in patients with diabetes or prediabetes.

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采用2017—2020年美国国家健康与营养调查数据,纳入7,835例糖尿病或糖尿病前期患者,采用logistic回归调整人口学、行为和代谢混杂因素,并通过平滑曲线拟合及分段阈值效应分析刻画剂量反应关系。以每日睡眠7—9小时为参照,短睡眠(<7小时)和长睡眠(≥9小时)均与心血管病风险升高独立相关,完全调整OR分别为1.27(95%CI:1.03—1.56,P=0.024)和1.37(95%CI:1.11—1.69,P=0.004)。存在明显非线性阈值效应,拐点为每日8.36小时;低于该阈值时,每增加1小时睡眠,心血管病风险降低11%(OR=0.89,95%CI:0.83—0.96,P=0.004);高于该阈值时,每增加1小时风险升高27%(OR=1.27,95%CI:1.13—1.42,P<0.001)。该非线性阈值效应在冠心病、心力衰竭和卒中中也一致观察到。结论认为,糖尿病或糖尿病前期患者每日睡眠时长与心血管病风险呈非线性关联,睡眠不足和过多均与心血管病风险升高相关。

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公共数据库综述BMJ digital health & AI

CLINES: Clinical LLM-based Information Extraction and Structuring Agent.

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**标题:CLINES:基于大语言模型的临床信息抽取与结构化智能体** **目的**:电子健康记录中的临床叙述包含结构化字段常缺失的诊断、治疗和时间信息,人工病历审查虽为事实标准,但耗时、昂贵且变异大。本研究旨在开发并评估CLINES——一种无需任务特定微调即可从自由文本中抽取并规范化临床概念、输出本体 grounded、可审计、模式就绪数据的流程。 **方法与分析**:CLINES为模块化多步流程,包括长文本语义分块、推理型大语言模型抽取、属性赋值(断言、值+单位)、UMLS规范化、显式与相对日期解析及聚合为i2b2风格模式。在去标识化MIMIC-III、4CE及CORAL(乳腺、胰腺)病历上评估,不进行任务特定监督训练。对照包括规则/词典系统、transformer编码器、单提示LLM基线、思维链LLM及全尺寸临床命名实体识别编码器。结局为实体、断言、值+单位和日期处理的F1,报告95% bootstrap置信区间及配对bootstrap、FDR校正检验。同时评估标注者间一致性、幻觉分类、成本和组件消融。 **结果**:在所有数据集和任务组合中,CLINES均排名第一。F1范围:实体0.69-0.87,断言0.84-0.93,值+单位0.77-0.90,日期0.73-0.79。较最强单提示LLM提升+0.21-0.38;transformer编码器在实体抽取上落后+0.28-0.68 F1。性能随病历长度保持稳定,而transformer基线召回率下降。代码字段增益及多数断言/值比较在FDR校正p<0.05下显著;交叉标注子集提及级标注者间F1为0.82(断言κ=0.85);对700个分层假阳性的七类分类发现54%的表观假阳性为标注缺口而非真实幻觉。 **结论**:CLINES将叙述性EHR文本转化为本体 grounded、可审计、模式就绪的数据,为队列发现和真实世界证据提供规模化类病历审查抽取的实用路径。CLINES大幅减少但未消除人工审查需求:所量化的残余幻觉意味着安全关键用途仍需人工验证。CLINES模型无关,可替换开源与闭源模型以满足成本、性能和隐私目标。

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最近 5 个完整年度引用趋势

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临床队列临床研究The Journal of clinical psychiatry

Electroconvulsive Therapy and the Long-Term Risk of Dementia: Conceptual Issues, Methodological Issues, and Recent Findings.

0 次引用趋势数据不足

电休克治疗(ECT)可诱导脑功能改变,需引发全面性发作方可起效,并伴随多较轻微且短暂的前行性和逆行性遗忘。有观点据此质疑ECT是否造成脑损伤并增加远期痴呆风险,这一问题因ECT治疗队列年龄偏大而尤为重要。本文审视相关概念、方法学及研究结果,指出ECT相关遗忘与痴呆的慢性、进行性、全面性损害特征并不相似,且无证据表明ECT与脑损伤的大体、微观或生物标志物指标相关,亦不与皮层萎缩、内侧颞叶萎缩、白质改变或脑微出血相关;相反,ECT可增强神经可塑性,使海马神经发生、树突分支及新突触形成呈剂量依赖性增加,并增加抑郁患者的海马体积。此外,ECT作为有效治疗可能改善被疾病放大的痴呆生活方式危险因素。近十年发表的4项队列研究(ECT组共8994例,对照组共277871例)平均随访5~25年,对混杂因素(包括适应证及适应证严重程度所致混杂)进行了适度校正,并将死亡作为竞争风险考虑,均未发现ECT与痴呆风险增加相关的证据。

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0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/11/01 19:00
合成生物学基础研究Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)

Programmable Engineered Living Vehicles as Autonomous Biofactories for Synergistic Osteomyelitis Management and Bone Regeneration.

0 次引用趋势数据不足

研究构建了一种可编程工程化活体载体(ELV),作为自主生物工厂用于耐药性骨髓炎治疗。该载体以具有生态优势的工程化大肠杆菌Nissle 1917为底盘,整合环境生物传感器与逻辑门计算模块,并借助AlphaFold 3引导的分子对接设计多尺度热响应遗传逻辑电路,实现37℃及以上条件下溶菌酶与血管活性肠肽的精准生物制造,42℃及以上触发失效保护性热自毁机制;表面修饰(DSS)6肽赋予其羟基磷灰石亲和力,形成骨靶向导航模块。在耐甲氧西林金黄色葡萄球菌诱导的大鼠骨髓炎模型中,静脉注射的ELV可自主导航至感染部位、主动穿透生物膜,病原清除效果优于万古霉素,并通过局部释放载荷重编程骨免疫微环境,显著加速骨修复。该研究为新一代智能活体治疗提供了可编程平台。

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该研究针对耐药性骨髓炎中生物膜难以穿透与骨再生失衡的问题,构建了可编程工程活体载药系统,实现温控分泌溶菌酶与血管活性肠肽并具备热自毁安全机制。其将合成生物学逻辑电路与骨靶向修饰结合,为智能活体治疗提供了可验证的新思路。

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Yang Lan、Xuemin Liu、Zhifeng Shi、Yuanlong Li、Ani Chi、Jiaqian Zheng、Tan Ye、Chuang Xiao、Rui Zheng、Yifan Yang、Xuetao Shi、Xufeng Zhu、Muyuan Chai、Shengtao Yan

作者机构

  • National Engineering Research Centre For Tissue Restoration and Reconstruction, South China University of Technology, Guangzhou, P. R. China.
  • School of Materials Science and Engineering, South China University of Technology, Guangzhou, P. R. China.
  • Guangdong Provincial Key Laboratory of Biomedical Engineering, South China University of Technology, Guangzhou, P. R. China.
  • Key Laboratory of New Drug Design, School of Pharmacy, East China University of Science and Technology, Shanghai, P. R. China.
  • Medical Devices Research & Testing Center, South China University of Technology, Guangzhou, P. R. China.
  • Orthopedics, Sun Yat-Sen Memorial Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou, P. R. China.
  • School of Ocean and Tropical Medicine, The Marine Biomedical Research Institute, Guangdong Medical University, Zhanjiang, P. R. China.
  • Department of Emergency, China-Japan Friendship Hospital, Beijing, P. R. China.

技术路线

数据/样本:工程化活体载具(ELV)基于大肠杆菌Nissl 1917底盘,表面修饰(DSS)6肽;体外及MRSA诱导的大鼠骨髓炎模型。分析:层级整合环境生物传感器与逻辑门计算模块,利用AlphaFold 3引导分子对接设计多尺度热响应遗传逻辑电路,实现≥37°C生产LYS和VIP、≥42°C热自毁。验证:在大鼠骨髓炎模型中静脉注射ELV,评估自主导航、生物膜穿透、病原清除(与万古霉素比较)及骨修复效果。

最近 5 个完整年度引用趋势

0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 07:01
合成生物学综述Molecular cell

Small genomes, big lessons: What viruses teach us about structure-based riboregulation.

0 次引用趋势数据不足

RNA病毒在单一分子内编码多层信息,该分子既作为蛋白质合成模板,又作为结构化调控RNA。这些结构控制病毒基因表达的关键环节,调控宿主相互作用并介导免疫逃逸。尽管RNA结构在病毒基因组中的普遍性已确立,但功能与机制研究直至近期才开始揭示这些元件如何作为调控模块影响感染结局。RNA病毒基因组紧凑、生命周期易于实验操作,是揭示核糖调控基本构件、阐明真核生物保守基因控制原理的有力模型系统。本文综述不同病毒家族中基于RNA结构的调控机制,并与真核转录组中结构介导的基因控制进行比较,强调RNA结构是基因表达的核心调控层,具有广泛的治疗与合成生物学潜力。

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该综述聚焦RNA病毒中RNA结构介导的基因调控,整合多病毒家族机制证据并与真核转录组类比,提出RNA结构为基因表达中心调控层。优势在于跨体系视角与机制梳理,但属叙述性综述,未提供系统检索策略或证据分级,病毒与真核间保守性的推断需谨慎解读。对治疗与合成生物学潜力的论述宜视为展望而非已验证结论。

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完整作者

Tanja Hann、Harim Jang、Yu-Chieh Sung、Chia-Lun Guh、Nicholas M Hiers、Lucille H Tsao、Michelle Luo、Anna Marie Pyle

作者机构

  • Department of Molecular Biophysics and Biochemistry, Yale University, New Haven, CT, USA.
  • Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, New Haven, CT, USA; Howard Hughes Medical Institute, Chevy Chase, MD, USA.
  • Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, New Haven, CT, USA.
  • Department of Chemistry, Yale University, New Haven, CT, USA.
  • Department of Molecular, Cellular, and Developmental Biology, Yale University, New Haven, CT, USA; Howard Hughes Medical Institute, Chevy Chase, MD, USA; Department of Chemistry, Yale University, New Haven, CT, USA. Electronic address: anna.pyle@yale.edu.

技术路线

综述性文章,未报告原始数据/样本;基于已有文献整合分析与跨病毒家族比较,无独立实验验证

最近 5 个完整年度引用趋势

0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 03:49
合成生物学基础研究Molecular & cellular proteomics : MCP

High-throughput protein interactome identifies LSD1 as a regulator of SARS-CoV-2 production through lysine demethylation of viral nucleocapsid protein.

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研究团队开发了基于分裂miRFP670nano3的近红外双分子荧光互补(NIR-BiFC)系统,并结合新一代测序建立NIR-BiFC-Seq,用于生理条件下蛋白质相互作用的高通量图谱绘制。应用该方法系统研究SARS-CoV-2核衣壳(N)蛋白与宿主细胞蛋白的相互作用,发现赖氨酸特异性去甲基化酶-1(LSD1)可对N蛋白K233位点去甲基化,增强N蛋白二聚化、与Nsp12互作、结合病毒RNA及液-液相分离等功能,从而促进病毒产生;靶向K233位点的抑制剂可显著抑制SARS-CoV-2产生。研究提示LSD1介导的调控机制可作为抗病毒治疗候选靶点。

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论文针对N蛋白互作组高通量解析难题,建立NIR-BiFC-Seq平台,鉴定LSD1去甲基化N蛋白K233并增强其功能与病毒产量。该工作为互作组研究提供灵敏工具,并提示K233为抗病毒干预的候选靶点。

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完整作者

Dujuan Liu、Chuang Yan、Jiangfeng Fu、Zili Liao、Youcheng Zhang、Haiyun Gan、Haokui Zhou、Xian-En Zhang、Minghai Chen

作者机构

  • State Key Laboratory of Quantitative Synthetic Biology, Shenzhen Institute of Synthetic Biology, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, China; School of Life Sciences, Henan University, Kaifeng, China.
  • State Key Laboratory of Quantitative Synthetic Biology, Shenzhen Institute of Synthetic Biology, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, China.
  • Faculty of Synthetic Biology, Shenzhen University of Advanced Technology, Shenzhen, China; State Key Laboratory of Biomacromolecules, Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences, Beijing, China. Electronic address: zhangxe@ibp.ac.cn.
  • State Key Laboratory of Quantitative Synthetic Biology, Shenzhen Institute of Synthetic Biology, Shenzhen Institutes of Advanced Technology, Chinese Academy of Sciences, Shenzhen, China; Faculty of Synthetic Biology, Shenzhen University of Advanced Technology, Shenzhen, China. Electronic address: mh.chen1@siat.ac.cn.

技术路线

['数据/样本:SARS-CoV-2 N蛋白与宿主细胞蛋白的相互作用体系;通过NIR-BiFC-Seq高通量鉴定互作组', '分析:筛选N蛋白与宿主蛋白互作,鉴定LSD1;分析LSD1对N蛋白K233位点的去甲基化作用及其对N蛋白二聚化、与Nsp12互作、病毒RNA结合和液-液相分离的影响', '验证:使用靶向K233位点的抑制剂检测对SARS-CoV-2产量的抑制效果']

最近 5 个完整年度引用趋势

0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 03:49
合成生物学综述Critical reviews in biotechnology

The historical evolution of CHO cell line development for biologics production: 60 years and still counting.

0 次引用趋势数据不足

中国仓鼠卵巢(CHO)细胞自20世纪50年代分离以来,一直在治疗性蛋白生产中发挥核心作用。数十年间,科学创新推动CHO细胞成为生物制药工业的重要工具。从早期简陋的培养条件和转基因随机整合,到合成生物学、基因工程、高性能化学成分明确培养基、靶向转基因整合及人工智能驱动的细胞系开发策略,每个十年都带来了改进CHO细胞系开发与表征过程的变革性工具、知识和见解。本综述按十年顺序梳理CHO细胞系开发历程,重点介绍关键里程碑与创新、技术突破,以及促成现代细胞系开发工作流程并最终实现生物药工业化生产的关键创新步骤的作用。

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AI 辅助短评,基于标题和摘要整理

本文为综述,按年代梳理CHO细胞系开发历程,从基础培养、随机整合到合成生物学、靶向整合及AI策略,归纳里程碑与创新。优点在于历史脉络清晰,突出技术演进对生物药生产的影响;但仅基于文献总结,未提供原始数据或系统验证,证据等级有限。适合作为领域入门与背景参考,不宜直接用于技术决策。

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完整作者

Juergen Fieder、Stefan Schneider、Simon Fischer

作者机构

  • Cell Line Development, Bioprocess Development Biologicals, Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG, Biberach, Germany.
  • University of Applied Sciences Biberach, Biberach, Germany.

技术路线

文献/历史资料 → 按年代梳理CHO细胞系开发进程

最近 5 个完整年度引用趋势

0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 07:01
临床队列临床研究Lancet (London, England)

Remibrutinib versus teriflunomide in relapsing multiple sclerosis (REMODEL-1 and REMODEL-2): two randomised, phase 3 trials.

0 次引用趋势数据不足

Remibrutinib是一种高选择性、强效、共价、可穿透中枢神经系统的口服BTK抑制剂。REMODEL-1和REMODEL-2为两项相同的随机、双盲、双模拟、活性对照、平行组、事件驱动Ⅲ期试验,在46个国家407个中心开展,纳入18-55岁、EDSS评分0-5.5、有近期疾病活动证据的复发型多发性硬化患者,按1:1随机接受口服remibrutinib 100 mg每日两次或特立氟胺14 mg每日一次,主要终点为年化复发率(ARR)。2021年12月13日至2025年12月30日筛查2632例,随机分配2007例;REMODEL-1纳入1000例,REMODEL-2纳入1007例。remibrutinib组ARR显著低于特立氟胺组:REMODEL-1为0.073 vs 0.112(RR 0.648,95%CI 0.453-0.927;p=0.018),REMODEL-2为0.080 vs 0.116(RR 0.688,95%CI 0.487-0.972;p=0.034)。最常见不良事件为上呼吸道感染、鼻咽炎、腹泻和脱发;导致停药的不良事件remibrutinib组较少(3.1% vs 5.8%),安全性与其他适应症一致,无肝脏安全性担忧。研究表明remibrutinib优于特立氟胺且安全性良好,支持其作为复发型多发性硬化潜在新型口服治疗选择。

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完整作者

Heinz Wiendl、Robert Bermel、Laura Airas、Tanuja Chitnis、Jin Nakahara、Mitzi Williams、Monika Adamczyk-Sowa、Karolina Piasecka-Stryczynska、Ronald Zielman、Sinead Dunphy、Nicolas Panchaud、Min Cai、Jing Xi、Brett Loop、Wendy Su、Roman Willi、Xavier Montalban、REMODEL Investigators

作者机构

  • Department of Neurology and Neurophysiology, University of Freiburg, Freiburg, Germany; Brain and Mind Centre, University of Sydney, Sydney, NSW, Australia. Electronic address: heinz.wiendl@uniklinik-freiburg.de.
  • Department of Neurology, Mellen Center for Multiple Sclerosis, Cleveland Clinic, Cleveland, OH, USA.
  • Turku PET Centre, Clinical Neurosciences and InFLAMES Research Flagship, University of Turku, Turku, Finland; Neurocenter, Turku University Hospital, Turku, Finland.
  • Brigham Multiple Sclerosis Center and Division of Neuroimmunology, Mass General Brigham, Boston, MA, USA.
  • Department of Neurology, Keio University School of Medicine, Tokyo, Japan.
  • Joi Life Wellness Neurology Clinic, Smyrna, GA, USA.
  • Department of Neurology, Faculty of Medical Sciences in Zabrze, Medical University of Silesia, Katowice, Poland.
  • MedPolonia, Outpatient MS Clinic, Poznań, Poland; Department of Medical Education and Communication, Poznan University of Medical Sciences, Poznań, Poland.
  • Novartis Pharma, Basel, Switzerland.
  • Novartis Ireland, Dublin, Ireland.
  • Novartis Institutes for Biomedical Research, Shanghai, China.
  • Novartis Pharmaceuticals Corporation, Cambridge, MA, USA.
  • Novartis Pharmaceuticals Corporation, East Hanover, NJ, USA.
  • Multiple Sclerosis Centre of Catalonia (Cemcat), Hospital Universitari Vall d'Hebron, Universitat de Vic-Universitat Central de Catalunya (UVic-UCC), Barcelona, Spain.

技术路线

数据/样本:REMODEL-1和REMODEL-2两项相同的随机、双盲、双模拟、活性对照、平行组、事件驱动3期试验,46国407中心,共随机2007例复发型多发性硬化成人患者(REMODEL-1 1000例,REMODEL-2 1007例)。分析:主要终点为年化复发率(ARR),在意向治疗(所有随机分配)人群中评估,比较remibrutinib 100 mg每日两次与特立氟胺14 mg每日一次,并报告安全性。验证:原文未报告独立验证或额外确认性分析。

最近 5 个完整年度引用趋势

0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 12:34
临床队列临床研究Nature medicine

Determinants of response to CAR T cell therapy in a multicenter, multi-trial cohort analysis of patients with lymphoma.

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一项多中心、多试验队列分析纳入580例接受抗CD19 CAR-T细胞疗法axicabtagene ciloleucel治疗的non-Hodgkin淋巴瘤患者,中位随访41.9个月,分析产品表型特征与疗效的关系。结果显示,naive-like(CCR7+CD45RA+)T细胞比例高是与无进展生存期延长相关的最显著特征(风险比=0.46,95%置信区间0.31-0.68,P=9.8×10⁻⁵,高比例组对低比例组),且不影响安全性。该关系独立于肿瘤微环境特征(112例评估)。多变量模型中,naive-like表型优于炎症标志物和肿瘤负荷等临床病理特征,校正产品扩增后仍显著。既往治疗线与产品和匹配单采样本中naive-like T细胞比例呈负相关,提示早期干预可能获益。关键发现在一个203例独立队列中得到验证。对116例亚组产品的质谱流式分析证实,缺乏TIGIT、LAG-3和PD-1等耗竭标志物表达的CD8 naive-like T细胞表型与无进展生存期相关。

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完整作者

Justin Budka、Madison Davis、Subing Cao、Jessica Ding、Jeremy Margaitis、Wangshu Zhang、Joshua Winters、Saran Vardhanabhuti、Yohei Arihara、Chad Williams、Soumya Poddar、Jerome Ritz、Mike Mattie、Priti Hegde、David M Barrett、Rhine Shen、Simone Filosto、Davide Bedognetti

作者机构

  • Kite, a Gilead Company, Santa Monica, CA, USA.
  • Sapporo Medical University School of Medicine, Sapporo, Japan.
  • Dana-Farber Cancer Institute, Boston, MA, USA.
  • Kite, a Gilead Company, Santa Monica, CA, USA. dbedognetti@kitepharma.com.

技术路线

数据/样本:多中心多试验队列,580例NHL患者接受axi-cel治疗(中位随访41.9个月),其中112例评估肿瘤微环境,116例产品行质谱流式分析,另203例独立队列(axi-cel为基础治疗或brexucabtagene autoleucel)用于验证 → 分析:分析产品表型属性(naive-like T细胞比例等),关联PFS与安全性;多因素模型比较naive-like表型与临床病理特征;分析既往治疗线与naive-like T细胞比例的相关性;质谱流式确认CD8 naive-like表型与PFS关联 → 验证:关键发现在203例独立队列中验证

最近 5 个完整年度引用趋势

0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 12:34
公共数据库研究类型未标注Nature genetics

Genome-wide detection of genotype-environment interactions at biobank scale with fastGxE.

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传统全基因组关联研究多关注基因主效应,常忽略基因-环境交互作用(GxE)。为此,研究者提出可扩展且有效的全基因组GxE分析方法fastGxE,用于识别与环境因素交互影响目标性状的遗传变异。该方法可控制多基因效应、多基因交互效应及噪声异质性,对参与交互的环境因素数量保持稳健,并确保大型生物样本库全基因组GxE分析的可扩展性,速度较现有方法提升32.98–126.49倍。通过广泛模拟及对英国生物样本库32项身体性状和67项血液生物标志物的深入分析,fastGxE在身体性状中识别出7个相关基因组位点(含4个新位点),在血液生物标志物中识别出18个相关位点(其中12个为新位点)。

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完整作者

Chao Ning、Xiang Zhou

作者机构

  • Department of Biostatistics, University of Michigan, Ann Arbor, MI, USA.
  • Department of Statistics and Data Science, Yale University, New Haven, CT, USA. xiang.zhou.xz735@yale.edu.

技术路线

数据/样本:UK Biobank的32项体格性状和67项血液生物标志物数据,辅以广泛模拟数据;分析:全基因组基因-环境交互分析(fastGxE),控制多基因效应、多基因交互效应和噪声异质性;无独立验证步骤报告

最近 5 个完整年度引用趋势

0110202102022020230202402025

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数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 12:35
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