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公共数据库共 51 篇
公共数据库基础研究Brain research

RAD51 expression in pan-cancer and its prognostic and immune mechanisms in glioma.

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胶质瘤是一种异质性恶性颅内肿瘤,预后差,缺乏有效的诊断和预后生物标志物。DNA修复基因RAD51参与肿瘤进展,但其在胶质瘤中的临床功能和免疫调节机制尚不明确。本研究利用TCGA、CGGA325和CGGA693胶质瘤队列数据分析RAD51表达及其与临床病理特征和预后的关系,并通过ROC曲线、生存分析、Cox回归和列线图建模进行临床评估,结合多种生物信息学分析探讨肿瘤免疫微环境调控,并使用临床标本验证蛋白表达。结果显示,RAD51在胶质瘤和泛癌中显著高表达,与肿瘤干性升高和不良预后相关;其高表达与高龄、较高WHO分级、IDH野生型和1p/19q非共缺失相关。RAD51诊断效能优异(AUC=0.960),为独立不良预后因素,验证的列线图可实现准确的风险预测。机制上,高RAD51与免疫抑制微环境相关,并与Th2细胞和巨噬细胞浸润增加相关;鉴定出19个核心RAD51相关免疫基因,均与不良预后相关。临床检测证实高级别胶质瘤中RAD51蛋白上调。研究表明,RAD51是胶质瘤稳健的诊断生物标志物和独立预后危险因素,与胶质瘤恶性特征相关,并显示与免疫基因表达改变和免疫抑制微环境的潜在联系,其列线图支持临床风险分层。

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Liubing Hou、Yu Wang、Xiang Zhan、Jiayuan Li、Zizhou Zhang、Weijing Cai、Linlin Su、Wei Han、Xuetao Han、Yue Han、Xiaolan Lv、Xiaoying Xue、Huandi Zhou

作者机构

  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China; Department of Central Laboratory, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: houliubing2022@163.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: wy51509297@163.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: zhanxiangfriend@163.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: ljyuan19950212@163.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: zhang000428202202@163.com.
  • Emergency Department, The Second Hospital of Bazhou City, Langfang, Hebei 065701, PR China. Electronic address: caidaifu@qq.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: sulinlin0405@163.com.
  • Department of Oncology, Hebei General Hospital, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: hanjue2542@sina.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: hxt9088@hebmu.edu.cn.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: 2241394256@qq.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: 1425744279@qq.com.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China; Hebei Key Laboratory of Etiology Tracing and Individualized Diagnosis and Treatment for Digestive System Carcinoma, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: xxy0636@hebmu.edu.cn.
  • Department of Radiotherapy, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China; Hebei Key Laboratory of Etiology Tracing and Individualized Diagnosis and Treatment for Digestive System Carcinoma, The Second Hospital of Hebei Medical University, Shijiazhuang, Hebei 050000, PR China. Electronic address: huandizhou@hebmu.edu.cn.

技术路线

公共队列数据(TCGA、CGGA325、CGGA693)→RAD51表达与临床病理/预后关联分析(ROC、生存分析、Cox回归、列线图)及多组学生物信息学免疫微环境分析→临床标本蛋白表达验证

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公共数据库综述Biochimie

Roles of one-carbon metabolism, folate and riboflavin in blood pressure: Can a precision nutrition approach reduce the risk of hypertension?

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英国生物库证据提示叶酸缺乏与高血压相关,约15%妊娠受高血压影响,增加母亲日后卒中及子代长期疾病风险。临床与全基因组关联研究将编码叶酸代谢酶MTHFR的C677T多态性与高血压风险增加相联系。核黄素作为MTHFR辅因子,随机试验显示其干预可降低MTHFR 677TT基因型个体血压,且独立于降压药物。该基因-营养素交互作用对TT基因型高频率人群尤为重要,如危地马拉(达66%)、墨西哥(32-44%)和中国北方(24%)。核黄素缺乏全球普遍,尤其女性,但常被忽视。本综述强调叶酸和核黄素在血压中的作用,以及通过解决核黄素缺乏优化叶酸代谢、以精准营养方法降低高危个体高血压风险的机会。

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本文综述叶酸、核黄素与血压的关联,强调MTHFR C677T基因-营养素交互作用,提出精准营养干预潜力。选题具有公共卫生意义,尤其对TT基因型高频人群。然而,证据主要基于观察性研究和有限随机试验,机制尚未阐明,核黄素干预的长期效果及人群适用性需进一步验证。文章未报告原始数据,结论应谨慎解读。

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Helene McNulty

作者机构

  • Nutrition Innovation Centre for Food and Health, School of Biomedical Sciences, Ulster University, Coleraine, Northern Ireland. Electronic address: h.mcnulty@ulster.ac.uk.

技术路线

['数据/样本:UK Biobank证据、临床研究、全基因组关联研究及随机试验(针对MTHFR C677T多态性、叶酸、核黄素与血压/高血压的关联)', '分析:综述叶酸介导的一碳代谢、叶酸和核黄素在血压调控中的作用,重点探讨MTHFR C677T基因-营养素交互作用及核黄素干预对TT基因型个体血压的影响', '验证:随机试验显示核黄素干预可降低MTHFR 677TT基因型个体的血压,独立于降压药物']

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公共数据库临床研究Annals of vascular surgery

Functional Vulnerability and Long-Term Mortality in Adults With Ankle-Brachial Index-Defined Peripheral Artery Disease: A NHANES Cohort Study.

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本研究基于美国国家健康与营养调查1999—2004年数据,纳入年龄≥40岁、具有踝臂指数(ABI)、身体功能及死亡随访信息的成年人,以最小ABI≤0.90定义外周动脉疾病(PAD)。研究构建纳入行走四分之一英里、上十级台阶、弯腰/下蹲/跪姿及长时间站立困难的功能脆弱指数(NFVI,0—4分),分析其与PAD及长期死亡率的关系。PAD队列共462人、375例死亡。校正社会人口学因素和改良心血管健康评分后,PAD与高NFVI相关(OR 1.748,95% CI 1.218—2.510)。在PAD患者中,校正社会人口学因素和最小ABI后,NFVI每增加1分与全因死亡相关(HR 1.095,95% CI 1.017—1.179);进一步校正改良心血管健康评分后,连续关联减弱(HR 1.075,95% CI 0.993—1.165),但高NFVI仍与死亡相关(HR 1.346,95% CI 1.026—1.767)。结论认为,功能脆弱在ABI定义的PAD成人中更常见,并与长期全因死亡相关,属流行病学关联,尚需前瞻性验证后才能临床使用。

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Mingxiu Wang、Yong Wang

作者机构

  • Affiliation: Affiliated Hospital of Xuzhou Medical University, Xuzhou, Jiangsu, 221002, P.R. China.
  • Affiliation: Affiliated Hospital of Xuzhou Medical University, Xuzhou, Jiangsu, 221002, P.R. China. Electronic address: mumei20071115@163.com.

技术路线

NHANES 1999-2004数据库人群(≥40岁,有ABI、躯体功能及死亡链接数据)→ABI≤0.90定义PAD,构建NFVI(0-4分)→调查加权模型分析PAD与NFVI、NFVI与全因死亡关联(校正社会人口学、mCVH、最低ABI)→原文未报告独立验证,仅以mCVH作额外校正

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公共数据库研究类型未标注American journal of obstetrics and gynecology

Hysterectomy-corrected, age-specific incidence and survival of uterine sarcomas by histotype, race and ethnicity in the United States, 2000-2019.

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基于美国SEER 22登记库2000—2019年数据,本研究纳入14 801例≥20岁镜下确诊的子宫肉瘤患者,按组织学类型、诊断分期及种族/民族计算校正子宫切除后的年龄别发病率和5年相对生存率。结果显示,平滑肌肉瘤最常见(53.3%),其次为子宫内膜间质肉瘤(26.7%)、腺肉瘤(12.7%)、未特指肉瘤(5.7%)和未分化肉瘤(1.7%)。平滑肌肉瘤校正发病率最高(0.6/10万),其次为子宫内膜间质肉瘤(0.3/10万)和腺肉瘤(0.1/10万)。非西班牙裔黑人各组织学类型发病率均最高,更易诊断时即为远处转移,生存率最低(41.9%),非西班牙裔白人为55.4%。平滑肌肉瘤、子宫内膜间质肉瘤和腺肉瘤5年相对生存率分别为42.3%、70.2%和78.3%;局限期各类型为62%~85%,远处转移期为13.5%~34.7%。结论认为,子宫肉瘤各组织学类型异质性明显,发病模式和生存轨迹不同;平滑肌肉瘤发病率最高、生存较差;非西班牙裔黑人发病率最高、晚期比例更高且生存更差。

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Dhruva Dave、Rebecca C Arend、Charles A Leath、Michael D Toboni、Nicolas Wentzensen、Martin Köbel、Britt K Erickson、Akemi T Wijayabahu、Megan A Clarke

作者机构

  • Department of Obstetrics & Gynecology, Division of Gynecologic Oncology, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL, USA. Electronic address: dhruvadave@uabmc.edu.
  • Department of Obstetrics & Gynecology, Division of Gynecologic Oncology, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL, USA.
  • Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute, Rockville, MD, USA.
  • Department of Pathology and Laboratory Medicine, Cumming School of Medicine, University of Calgary, Calgary, Alberta, Canada.
  • Department of Obstetrics, Gynecology, and Women's Health, University of Minnesota, Minneapolis, MN.
  • Department of Obstetrics & Gynecology, Division of Gynecologic Oncology, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL, USA; Division of Cancer Epidemiology and Genetics, National Cancer Institute, Rockville, MD, USA.

技术路线

数据/样本:SEER 22登记库2000-2019年、年龄≥20岁、显微镜确诊的子宫肉瘤病例(n=14,801),按组织学亚型、诊断分期、种族/民族分层;分析:基于SEER*Stat 9.0.42计算子宫切除校正的年龄别发病率,采用Ederer II法估计5年相对生存率;验证:原文未报告独立的模型验证或外部验证。

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公共数据库临床研究Headache

Opioids as the earliest acute treatment for emergency department headache and short-term all-cause emergency department return: A two-center comparative cohort study.

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一项回顾性双中心队列研究比较急诊急性头痛一线治疗类别与短期全因急诊回归的关系。研究对象为急诊接受头痛治疗的成人(MIMIC-IV-ED,2011-2019;MC-MED,2020-2022),一线治疗取最早使用的合格急性药物,主要比较阿片类与指南偏好的多巴胺受体拮抗剂。主要结局为出院患者72小时全因急诊回归,7天回归为次要结局,采用校正风险比(RR)及95%置信区间(CI)报告。共纳入13285例接受治疗成人(MIMIC-IV-ED 10799例;MC-MED 2486例)。MIMIC-IV-ED中阿片类接受者较老(中位48岁对39岁),分诊高危比例更高(51.7%对29.5%)。一线阿片类与较高72小时全因急诊回归相关(校正风险6.8%对3.8%;RR 1.78;95%CI 1.31-2.32),7天回归亦较高(10.7%对6.6%;RR 1.62;95%CI 1.28-1.99)。MC-MED结果方向一致但仅示方向。限定头痛编码或头痛分诊回归后关联减弱且无统计学意义(72小时RR 1.31;95%CI 0.91-1.88)。结论认为,选择一线阿片类者较老、病情更重,在两个医疗系统均更常在72小时和7天内回归;这些风险校正关联以出院为条件,反映全因急诊利用而非确诊头痛复发,不能证明改变一线类别会改变回归率,头痛特异性结果减弱既可能与行政编码不足一致,也可能与无关联一致,不构成处方阿片类的理由。

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Alon Gorenshtein、Yosef Adiniaev、Tom Liba、Eyal Klang、Oved Daniel

作者机构

  • Department of Neurology, Beth Israel Deaconess Medical Center, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts, USA.
  • BRIDGE GenAI Lab, Beth Israel Deaconess Medical Center, Boston, Massachusetts, USA.
  • Azrieli Faculty of Medicine, Bar-Ilan University, Safed, Israel.
  • Department of Radiology, Beth Israel Deaconess Medical Center, Harvard Medical School, Boston, Massachusetts, USA.
  • Neurology Division, Tel Aviv Sourasky University Medical Center, Tel Aviv, Israel.

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公共数据库基础研究Microbiology spectrum

Inhibitory activity and mechanism of a scorpion-derived peptide BmKDfsin3 against SFTSV and HSV-1.

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研究人员发现蝎源肽BmKDfsin3在A549细胞中呈浓度依赖性抑制严重发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)和单纯疱疹病毒1型(HSV-1)的复制。抗病毒时相实验显示,该肽主要作用于两种病毒生命周期的入侵后阶段。机制上,BmKDfsin3可有效抑制SFTSV和HSV-1感染诱导的p38活化;以poly(I:C)作为病毒模拟物时,该肽通过激活转录因子p52和IRF3增强I型和III型干扰素信号通路。安全性方面,BmKDfsin3细胞毒性、溶血活性和小鼠毒性均较低。研究表明,BmKDfsin3是一种具有良好生物安全性、强效抗病毒活性和广谱抗病毒谱的天然生物活性肽,其通过抑制病毒利用宿主p38信号及激活宿主免疫发挥双重抗病毒作用。

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Fang Sun、Hongyi Luo、Luyao Wang、Zhiqiang Xia、Zongyun Chen、Zhijian Cao

作者机构

  • National "111" Center for Cellular Regulation and Molecular Pharmaceutics, Key Laboratory of Fermentation Engineering (Ministry of Education), Hubei University of Technology, Wuhan, China.
  • Institute of Biomedicine, Hubei Key Laboratory of Embryonic Stem Cell Research and Hubei Key Laboratory of Wudang Local Chinese Medicine Research, College of Basic Medicine, Hubei University of Medicine, Shiyan, China.
  • Zhejiang Key Laboratory of High-level Biosafety and Biomedical Transformation, Hangzhou Medical College, Hangzhou, China.
  • School of Biological and Food Processing Engineering, Huanghuai University, Zhumadian, China.

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公共数据库综述The American journal of surgical pathology

Endometrioid Carcinoma With Malignant Squamous Differentiation: Clinicopathologic, Immunohistochemical, and Molecular Analysis.

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回顾分析了2020年1月至2025年3月诊断的3696例子宫内膜子宫内膜样癌,依据预设组织学标准识别出9例伴恶性鳞状分化的肿瘤,全部病例均接受集中切片复核、免疫组化 panel 及靶向下一代测序,并按FIGO 2023分期及TCGA/ProMisE分子分型分类。结果显示,恶性鳞状分化罕见,但与不良病理特征(深肌层浸润、广泛淋巴血管间隙浸润及频繁淋巴结转移)密切相关;术前活检和刮宫常低估或误判该成分。恶性鳞状成分主要占据浸润前沿和转移灶,并一致表现为激素受体表达缺失。分子分析显示4种分子亚型均存在异质性,PI3K/AKT通路反复出现改变。结论认为,该侵袭性表型跨越不同分子亚型,传统形态学评估仍不可或缺。

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公共数据库临床研究Science progress

Multisystem assessment of the association between physical activity and biological aging: Evidence from a national cross-sectional survey.

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一项基于美国国家健康与营养调查(NHANES)2003—2010年及2015—2018年数据的横断面研究,纳入13379名中老年人,按自报每周身体活动量(MET-min/周)分为低(<600)、中(600—3000)、高(>3000)三级,综合适应负荷、稳态失调、表型年龄加速和Klemera-Doubal法生物学年龄加速四项指标评估身体活动与多维生物学衰老的关联。加权多变量线性回归显示,调整协变量后,中等水平身体活动与较低的适应负荷(β=-0.219)、表型年龄加速(β=-0.524)和KDM年龄加速(β=-0.638)独立相关;高水平身体活动在各模型中均无显著关联。剂量反应曲线呈非线性,中等水平估计值最有利。亚组分析显示,高水平身体活动在各年龄组与KDM年龄加速呈一致正相关,在癌症幸存者中与稳态失调呈反向关联。结论认为,相对于低水平活动,中等水平身体活动与更有利的生物学衰老指标相关,但关联因维度和亚组而异,未来需开展纵向及干预研究。

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公共数据库基础研究Nucleic acids research

VarNexus: an integrative database for interpreting disease-associated regulatory variants through multimodal predictions and functional evidence.

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VarNexus是一个整合数据库,旨在连接疾病相关变异与预测性、群体性及实验性证据,以辅助非编码风险变异的功能解读。该资源收录了来自UK Biobank和FinnGen的1891种疾病相关表型的230404个精细定位候选变异,整合了AlphaGenome对11种调控输出类型的预计算预测,以及批量与单细胞xQTL、MPRA测量和GWAS-eQTL共定位结果。数据库支持按变异、表型和基因进行交叉检索,并提供按需AlphaGenome预测、多组学基因组浏览器可视化和调控网络探索功能。通过结合基于序列的预测与群体及实验证据,VarNexus为优先筛选获得多层证据支持的候选调控机制提供了框架。

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Lihai Gong、Cheng Tan、Jinhui Zhang、Rigan Shu、Shutong Guo、Tingting Xiao、Jialin Shi、Jing Wang、Ting Ni、Ruofan Ding

作者机构

  • Institutes of Biomedical Sciences, Inner Mongolia University, Hohhot 010070, China.
  • College of Informatics, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China.
  • State Key Laboratory of Genetic Engineering, National Clinical Research Center for Aging and Medicine, Huashan Hospital, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, Human Phenome Institute, Shanghai Engineering Research Center of Industrial Microorganisms, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200438, China.

技术路线

数据/样本:UK Biobank与FinnGen的1891个疾病相关表型中230,404个精细定位候选变异,整合预计算AlphaGenome 11类调控输出、bulk与单细胞xQTL、MPRA测量及GWAS-eQTL共定位结果 → 分析:按变异、表型、基因交叉检索,按需AlphaGenome预测、多组学基因组浏览器可视化及调控网络探索

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0110202102022020230202402025

不含 2026 年,仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源:openalex更新时间:2026/10/29 12:35
公共数据库基础研究Scientifica

Metformin Attenuates Glucose-Driven Hepatocellular Carcinoma Progression by Targeting GPD2-Mediated Metabolic Plasticity.

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高糖促进肝癌HepG2和Huh7细胞增殖与迁移,且不同于A549细胞,肝癌细胞在葡萄糖缺乏下仍维持生长,提示其代谢可塑性。GPD2在肝癌组织中显著上调并与不良生存相关。二甲双胍呈剂量依赖性抑制细胞增殖和迁移,低糖条件下作用更强;机制上下调Cyclin D1和XIAP、诱导Caspase-3剪切、降低EMT标志物Slug。GPD2与CCND1、SNAI2呈正相关,提示其与细胞周期及EMT信号相关。结论:肝癌细胞借助GPD2介导的代谢适应在限糖条件下维持生长,GPD2可作为预后生物标志物和治疗靶点;二甲双胍通过干扰GPD2相关促生存及EMT通路抑制肝癌进展。

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