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公共数据库基础研究Zoological research

Repeated imiquimod challenge as an experimental model of psoriasiform inflammation and re-exposure associated reactivation.

Xin Tong、Zhan Zhang、Zi-Hao Li 等DOI: 10.24272/j.issn.2095-8137.2026.139

MIMIC 单细胞成人方法学

0 次引用趋势数据不足

长期银屑病管理仍是全球难题。 repeated IMQ应用虽用于模拟银屑病炎症再激活，但其反映的是急性炎症放大还是组织驻留记忆相关特征尚不清楚。研究建立重复IMQ激发模型（IMQ-R），并与单疗程IMQ模型（IMQ-S）及人类银屑病皮损比较，采用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析。结果显示，在末次诱导阶段，IMQ-R较IMQ-S更快再现皮肤炎症，并在既往受激发皮肤中表现炎症再激活特征，包括IL-17相关通路、TRM相关T细胞特征及预测的多细胞通讯模式。单细胞分析显示，IMQ-R细胞组成较IMQ-S更接近活动性人类银屑病皮肤，表现为角质形成细胞扩增、内皮细胞富集及T细胞群体相对保留；记忆相关标注的T细胞亚群（包括TCM和TRM）增加，尤其富集TRM17相关转录特征，并增强T细胞、角质形成细胞和髓系细胞间预测通讯（包括IL-17相关信号通路）。结论认为，重复IMQ激发可形成具有炎症加速再现及再暴露时TRM相关特征的银屑病样模型，传统急性IMQ模型未完全体现这些特征，该模型可用于研究重复激发后的炎症再激活及评估靶向皮肤记忆相关炎症程序的干预。

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Xin Tong、Zhan Zhang、Zi-Hao Li、Cheng-Xin Li、Xu-Ming Zhou、Rui Wang

作者机构

Department of Dermatology, Chinese PLA General Hospital, Medical College of Chinese PLA, Beijing 100853, China.
Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China.
University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China.
Department of Dermatology, Chinese PLA General Hospital, Medical College of Chinese PLA, Beijing 100853, China. E-mail: chengxinderm@163.com.
Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China. E-mail: zhouxuming@ioz.ac.cn.
Department of Dermatology, Chinese PLA General Hospital, Medical College of Chinese PLA, Beijing 100853, China. E-mail: wr0699@163.com.

技术路线

['数据/样本：单次IMQ模型（IMQ-S）、重复IMQ挑战模型（IMQ-R）及人银屑病皮损', '分析：bulk RNA-seq与single-cell RNA-seq，比较炎症再激活特征、细胞组成、T细胞亚群及多细胞通讯预测']

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数据来源：openalex更新时间：2026/10/29 03:45

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临床队列临床研究Nature medicine

Insights into early-onset colorectal cancer from a single-nucleus RNA-seq atlas of colorectal cancer across the age continuum.

Caroline B M Porter、Shane P Murphy、Jules Cazaubiel 等DOI: 10.1038/s41591-026-04721-y

肿瘤与癌症机器学习单细胞多中心队列研究

0 次引用趋势数据不足

早发性结直肠癌（EO-CRC，50岁前确诊）的全球发病率持续上升，但与其生物学特征相关的分子差异尚不明确。为此，研究者构建了涵盖八个十年年龄段、共189例原发性结直肠癌肿瘤（54例EO-CRC，135例AO-CRC）的单核RNA测序图谱，并按微卫星状态分层，同时考虑肿瘤侧别、分期、患者性别及新辅助治疗史。结果显示，在微卫星稳定肿瘤中，年轻患者肿瘤表现为基质比例增加、上皮比例减少，该结果在712例MSS CRC外部队列中得到多光谱免疫荧光和机器学习验证。年轻患者肿瘤上皮细胞的长非编码RNA和FN1表达增加，拷贝数改变异质性呈增加趋势。MSS左侧EO-CRC肿瘤的细胞间相互作用更多，上皮-间质转化相关信号通路（FN1/GDF/ACTIVIN）的细胞类型特异性相互作用增强。该高分辨率图谱揭示了结直肠癌的年龄相关特征，为理解EO-CRC生物学提供了资源。

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Caroline B M Porter、Shane P Murphy、Jules Cazaubiel、Toni M Delorey、Liat Amir-Zilberstein、Orr Ashenberg、Liubou Klindziuk、Elizabeth Andrews、William Tan、Kosuke Matsuda、Atsushi Kondo、Satoko Ugai、Tomotaka Ugai、Shuji Ogino、Emily Finan、Jacques Deguine、Ewa Sicinska、Lauren K Brais、Jennifer S Thalappillil、Marios Giannakis、Ramnik J Xavier、Ana C Anderson、Kimmie Ng

作者机构

Klarman Cell Observatory, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
Department of Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA.
Program in Molecular Pathological Epidemiology, Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Department of Pathology, Keio University, Tokyo, Japan.
Division of Integrative Cancer Science, National Cancer Center Research Institute, Tokyo, Japan.
Department of Epidemiology, Harvard T.H. Chan School of Public Health, Boston, MA, USA.
Division of Nutrition, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Institute of Science Tokyo, Tokyo, Japan.
Klarman Cell Observatory, Broad Institute of MIT and Harvard, Cambridge, MA, USA. rxavier@broadinstitute.org.
Center for Computational and Integrative Biology, Department of Molecular Biology, Massachusetts General Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA, USA. rxavier@broadinstitute.org.
Gene Lay Institute of Immunology and Inflammation of Brigham and Women's Hospital, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, USA. rxavier@broadinstitute.org.
Gene Lay Institute of Immunology and Inflammation of Brigham and Women's Hospital, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, Boston, MA, USA. acanderson@bwh.harvard.edu.
Ann Romney Center for Neurologic Diseases, Brigham and Women's Hospital, Harvard Medical School, Boston, MA, USA. acanderson@bwh.harvard.edu.
Department of Medical Oncology, Dana-Farber Cancer Institute, Harvard Medical School, Boston, MA, USA. Kimmie_Ng@DFCI.HARVARD.EDU.

技术路线

189例原发CRC肿瘤（54例EO-CRC、135例AO-CRC）单核RNA测序构建图谱→按微卫星状态分层并纳入肿瘤部位、分期、性别、新辅助治疗史，以连续或分类年龄建模分析→外部712例MSS CRC队列（18例EO-CRC、694例AO-CRC）经多光谱免疫荧光与机器学习验证基质/上皮比例差异

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数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 19:00

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公共数据库临床研究PloS one

Elucidating the toxicogenomic mechanisms of DBP exposure on Hepatocellular carcinoma through network toxicology and molecular docking analysis.

Dafei Dai、Nianzhao Yang、Fubao Liu 等DOI: 10.1371/journal.pone.0359516

TCGA GEO 肿瘤与癌症单细胞风险模型

暂无引用数据

本研究采用网络毒理学与生物信息学方法，探讨邻苯二甲酸二丁酯（DBP）参与肝细胞癌（HCC）发病的分子机制。通过ADMETLAB 3.0和ProTox3评估DBP致癌潜力，从ChEMBL、SwissTargetPrediction和PharmMapper获取DBP相关靶点，从GeneCards和OMIM获取HCC相关靶点，经Venn分析识别出242个重叠基因。PPI网络分析确定KRAS、GRB2、ESR1、HSP90AA1、SRC、EGFR和TP53共7个枢纽基因，富集分析显示其显著参与癌症相关通路。TCGA与GEO数据验证GRB2、ESR1、HSP90AA1和SRC在HCC组织中显著失调并与患者生存相关，预后模型预测准确性良好。单细胞分析显示ESR1（肝细胞）和HSP90AA1（免疫细胞）呈特异性表达模式。分子对接显示DBP与ESR1和HSP90AA1稳定结合，结合能分别为-6.8和-6.1 kcal/mol，分子动力学模拟支持复合物稳定性，范德华力为主要结合力。研究提示DBP暴露可能通过调控核心基因和通路参与HCC发病，但结果仅为关联性，尚需实验验证；ESR1和HSP90AA1等枢纽基因可作为潜在生物标志物和靶点。

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Dafei Dai、Nianzhao Yang、Fubao Liu、Xiaopeng Chen

作者机构

Department of General Surgery, The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University, Hefei, Anhui, China.
Department of General Surgery, The First Affiliated Hospital of Wannan Medical College (Yijishan Hospital of Wannan Medical College), Wuhu, Anhui, China.

技术路线

数据/样本：ChEMBL、SwissTargetPrediction、PharmMapper获取DBP相关靶点，GeneCards、OMIM获取HCC相关靶点；TCGA-LIHC与GEO GSE39791用于表达验证和生存分析；GSE299340单细胞数据；ADMETLAB 3.0与ProTox3评估致癌潜力。分析：Venn分析重叠基因；STRING构建PPI网络，Cytoscape识别hub基因；DAVID进行GO/KEGG富集；构建预后列线图；Seurat分析单细胞表达。验证：分子对接与分子动力学模拟评估DBP与核心靶点结合稳定性（原文为计算模拟，非实验验证）。

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公共数据库基础研究Nucleic acids research

VarNexus: an integrative database for interpreting disease-associated regulatory variants through multimodal predictions and functional evidence.

Lihai Gong、Cheng Tan、Jinhui Zhang 等DOI: 10.1093/nar/gkag1056

UK Biobank 单细胞多组学方法学

0 次引用趋势数据不足

VarNexus是一个整合数据库，旨在连接疾病相关变异与预测性、群体性及实验性证据，以辅助非编码风险变异的功能解读。该资源收录了来自UK Biobank和FinnGen的1891种疾病相关表型的230404个精细定位候选变异，整合了AlphaGenome对11种调控输出类型的预计算预测，以及批量与单细胞xQTL、MPRA测量和GWAS-eQTL共定位结果。数据库支持按变异、表型和基因进行交叉检索，并提供按需AlphaGenome预测、多组学基因组浏览器可视化和调控网络探索功能。通过结合基于序列的预测与群体及实验证据，VarNexus为优先筛选获得多层证据支持的候选调控机制提供了框架。

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Lihai Gong、Cheng Tan、Jinhui Zhang、Rigan Shu、Shutong Guo、Tingting Xiao、Jialin Shi、Jing Wang、Ting Ni、Ruofan Ding

作者机构

Institutes of Biomedical Sciences, Inner Mongolia University, Hohhot 010070, China.
College of Informatics, Huazhong Agricultural University, Wuhan 430070, China.
State Key Laboratory of Genetic Engineering, National Clinical Research Center for Aging and Medicine, Huashan Hospital, Collaborative Innovation Center of Genetics and Development, Human Phenome Institute, Shanghai Engineering Research Center of Industrial Microorganisms, School of Life Sciences, Fudan University, Shanghai 200438, China.

技术路线

数据/样本：UK Biobank与FinnGen的1891个疾病相关表型中230,404个精细定位候选变异，整合预计算AlphaGenome 11类调控输出、bulk与单细胞xQTL、MPRA测量及GWAS-eQTL共定位结果 → 分析：按变异、表型、基因交叉检索，按需AlphaGenome预测、多组学基因组浏览器可视化及调控网络探索

最近 5 个完整年度引用趋势

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数据来源：openalex更新时间：2026/10/29 12:35

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AI 靶点发现综述Ageing research reviews

Aging, regeneration, and peripheral nerve repair: Integrated multi-omics biomarkers and AI-enabled therapeutic discovery approaches.

Muhanad Musaad Alhujaily、Amal Adnan Ashour、Alaa Shafie 等DOI: 10.1016/j.arr.2026.103424

机器学习单细胞多组学综述

0 次引用趋势数据不足

周围神经损伤是长期感觉和运动功能障碍的重要原因，造成显著临床和社会经济负担。周围神经虽具有内在再生能力，但轴突变性、施万细胞可塑性、神经免疫反应、细胞外基质重塑、代谢重编程、髓鞘再生及靶向再支配等过程相互作用，常导致功能恢复不完全。转录组学、蛋白质组学、表观基因组学、代谢组学和单细胞技术的发展拓展了对神经变性与再生的分子表征，揭示出众多候选生物标志物和治疗靶点，但生物学异质性、数据集碎片化及缺乏稳健预测框架仍限制临床转化。本文综述周围神经修复的细胞与分子机制，梳理与再生能力、神经炎症、髓鞘再生和功能恢复相关的新型生物标志物类别，讨论靶向施万细胞重编程、轴突生长、免疫调节、代谢适应及再生微环境重塑的治疗策略，并分析人工智能和机器学习在多组学整合、生物标志物优选、结局预测和治疗靶点发现中的潜在作用，同时指出周围神经损伤特异性临床验证仍然有限。文章提出连接分子特征与临床结局的系统级框架，强调人工智能赋能的多模态分析对转化研究的支持潜力，并将年龄相关分子变异纳入分析维度，为未来转化研究中检验年龄感知分子标志物和计算模型提供框架。

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AI 辅助短评，基于标题和摘要整理

本文系统梳理周围神经损伤修复的细胞分子机制与候选生物标志物，提出将年龄相关分子变异纳入分析维度、以AI/ML整合多组学并连接临床结局的系统框架。其价值在于为年龄感知型标志物与计算模型的后续转化验证提供整合性研究思路。

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Muhanad Musaad Alhujaily、Amal Adnan Ashour、Alaa Shafie、Farah Anjum、Tooba Naz Shamsi、Taj Mohammad

作者机构

Department of Biochemistry, College of Medicine, Imam Mohammad Ibn Saud Islamic University (IMSIU), Riyadh, Saudi Arabia; Saudi German Hospital Research Center, Middle East Healthcare Company, Jeddah, Saudi Arabia; King Salman Center for Disability Research, Riyadh, 11614, Saudi Arabia.
Department of Oral and Maxillofacial Surgery and Diagnostic Sciences, Faculty of Dentistry, Taif University, PO Box 11099, Taif, 21944, Saudi Arabia; King Salman Center for Disability Research, Riyadh, 11614, Saudi Arabia.
Department of Clinical Laboratory Sciences, College of Applied Medical Sciences, Taif University, P.O Box 11099, Taif, 21944, Saudi Arabia; King Salman Center for Disability Research, Riyadh, 11614, Saudi Arabia.
Department of Biosciences, Faculty of Sciences, Integral University, Lucknow, 226026, India.
Department of Biochemistry, Faculty of Medicine and Dentistry, University of Alberta, Edmonton, Alberta, T6G 2H7, Canada. Electronic address: tshamsi@ualberta.c.
Centre for Interdisciplinary Research in Basic Sciences, Jamia Millia Islamia, Jamia Nagar, New Delhi, 110025, India. Electronic address: taj144796@st.jmi.ac.in.

技术路线

综述性文章，无原始数据/样本与分析流程；技术路线为：多组学（转录组、蛋白质组、表观基因组、代谢组、单细胞）及人工智能/机器学习方法综述→多组学整合、生物标志物优先级排序、结局预测与治疗靶点发现的分析框架讨论→指出PNI特异性临床验证有限，并提出未来转化研究中的验证设想

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数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 03:55

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公共数据库临床研究Frontiers in genetics

Donor-aware multi-cohort single-cell analysis identifies an LXR-linked tubular cholesterol-handling state in membranous nephropathy with a coordinated five-gene lipid-remodeling signature across renal tumors.

作者信息暂未整理DOI: 10.3389/fgene.2026.1916595

TCGA 肿瘤与癌症单细胞队列研究

暂无引用数据

膜性肾病（MN）是免疫介导的肾小球疾病，持续蛋白尿使肾小管上皮细胞暴露于异常滤过蛋白负荷，其小管代谢反应尚不清楚。研究分析3个肾脏单细胞RNA测序数据集及1个肾小球 bulk 转录组队列，以供体为生物学重复，评估冻结的47基因LXR相关胆固醇处理程序及37基因胆固醇转运/外排组分，并在HK-2细胞蛋白过载后行qRT-PCR验证代表基因。结果：GSE241302中全部3例MN供体程序评分在近端小管（PT）和髓袢/厚升支高于内部参照；OEP004186中PT效应+0.480（FDR 0.0128）、PT-VCAM1 +0.348（FDR 0.0165）、髓袢/远端上皮+0.310（FDR 0.0242），逐一剔除MN供体分析均为正效应；GSE171458呈一致方向支持。PT-VCAM1比例未增加，但程序在PT及PT-VCAM1内均升高，支持状态内转录改变。16个程序基因在3个单细胞资源中平均效应为正。GSE200828中MN总体程序高于活体供肾（+0.226，FDR 0.0349），但不高于其他肾小球疾病。蛋白过载使HK-2细胞ABCA1、ABCG1、SREBF1、FASN、SCD表达升高。同一五基因面板在3种肾癌组织学中呈一致配对升高（REML合并效应+0.967，95%CI 0.843-1.092），85.3%患者胆固醇外排与脂质合成/重塑两臂同时升高。结论：MN与供体支持的LXR相关胆固醇处理转录状态相关，集中于PT及髓袢/TAL相关上皮区室，该状态对HK-2细胞蛋白过载有反应，可能反映蛋白尿性肾损伤的更广泛小管脂质稳态反应；数据未确立直接LXR激活、胆固醇外排通量增加或MN特异性。配对肾癌分析进一步识别出KIRC、KIRP、KICH中协调的肿瘤相关五基因脂质重塑特征，但未确立肿瘤细胞内在LXR激活、免疫效应或因果肿瘤机制。

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公共数据库基础研究Frontiers in oncology

Integrated transcriptomic and single-cell analyses define neuronal heterogeneity and PDIA4-associated malignancy in glioblastoma.

作者信息暂未整理DOI: 10.3389/fonc.2026.1971414

TCGA GTEx 肿瘤与癌症单细胞风险模型

暂无引用数据

胶质母细胞瘤（GBM）具有显著的细胞异质性及恶性细胞与微环境的复杂互作，但神经元群体对GBM进展和预后的贡献尚不明确。研究整合TCGA-GBM与GTEx的批量转录组数据及两个单细胞RNA测序数据集，采用差异表达分析、WGCNA、机器学习生存建模、CIBERSORT、GSEA、CopyKAT、MiloR、拟时序分析、GSVA、CellChat和pySCENIC等方法刻画预后基因及其细胞背景，并在U251和U87细胞中通过siRNA敲低PDIA4后行Western blotting、qPCR、Transwell侵袭、划痕愈合、集落形成和CCK-8实验。最终预后模型保留PDIA4、CAMK2N1、RPH3A、RAB11FIP4、DMTN、EPHB6、SLC47A2、ESM1和EMILIN2九个预后基因。单细胞分析显示这些基因具有不同的细胞分布，并鉴定出GBM中富集的肿瘤相关神经元群体；拟时序分析揭示正常与肿瘤相关神经元状态间的转录差异，CellChat预测神经元群体与GBM细胞间NRXN-NLGN通讯发生改变。免疫解卷积显示多个预后基因与免疫细胞组成相关，其中PDIA4与活化NK细胞呈负相关。实验中PDIA4在U251和U87细胞中的表达高于SVG p12细胞，敲低PDIA4可降低两株GBM细胞的克隆生长、侵袭、划痕愈合及CCK-8代谢活性读数。研究将GBM预后与肿瘤微环境中独特的神经元和免疫特征相联系，将九基因预后特征置于GBM细胞结构中，并提示肿瘤相关神经元状态可能是预后肿瘤生态系统的组成部分；PDIA4敲低为该特征某一组分提供了功能支持，预测的NRXN-NLGN网络则为神经元-GBM通讯提供了待研究途径。

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公共数据库综述Frontiers in immunology

GlycoRNA-related cellular program scoring identifies Siglec- and myeloid-associated tumor microenvironments for glycoRNA validation.

作者信息暂未整理DOI: 10.3389/fimmu.2026.1928501

TCGA 肿瘤与癌症单细胞 Meta 分析

0 次引用趋势数据不足

糖基化RNA（glycoRNA）是RNA生物学与细胞表面糖生物学之间的新联系，但其与人类肿瘤的相关性尚不明确。研究团队基于文献证据构建了涵盖RNA身份、N-聚糖与唾液酸化通路、RNA转运及凝集素/Siglec识别的基因模块，并建立表达-based复合评分——glycoRNA相关细胞程序评分，用于在大型肿瘤队列中优先筛选适合实验验证的肿瘤情境。该评分应用于TCGA 32种癌症类型的9,186例肿瘤，并结合临床变量、白细胞分数、免疫特征及Siglec/检查点/髓系轴评分分析。结果显示，胃腺癌、胶质母细胞瘤、肺腺癌、食管癌、间皮瘤、胰腺癌、乳腺癌和肺鳞癌等肿瘤类型评分较高；校正年龄、性别、分期和肿瘤类型后，生存分析未显示稳健的FDR显著关联。去除免疫和Siglec相关基因后的敏感性分析中，评分仍与Siglec解码器、髓系、检查点及整合生态位特征相关。胶质母细胞瘤单细胞和空间分析显示，高评分见于肿瘤、髓系、间充质及生态位相关区域。研究提示，glycoRNA相关转录程序倾向于发生在免疫和髓系富集的肿瘤微环境中，尤其涉及Siglec相关特征，为后续生化、影像、空间和扰动实验验证提供了优先肿瘤情境。

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作者机构

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数据来源：openalex更新时间：2026/11/01 02:24

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临床队列方法学Nature methods

CytoVI: deep generative modeling of antibody-based single cell data.

Florian Ingelfinger、Nathan Levy、Can Ergen 等DOI: 10.1038/s41592-026-03224-5

单细胞队列研究方法学

0 次引用趋势数据不足

基于抗体的单细胞技术（如流式细胞术、质谱流式细胞术和CITE-seq）已广泛应用于临床诊断和基础研究，但其分析受到技术噪声、批次效应、平台差异和抗体组合受限等因素的影响。为此，研究提出CytoVI——一种概率生成模型，用于对基于抗体的单细胞数据进行统计严谨的统一分析。CytoVI可在单一概率模型中生成信息丰富的细胞嵌入、填补缺失测量值、进行差异蛋白表达检验并自动注释细胞。研究应用CytoVI构建了涵盖350种蛋白的B细胞成熟整合图谱，识别出与免疫球蛋白类别转换相关的蛋白；在经流式细胞术和CITE-seq分析的B细胞非霍奇金淋巴瘤患者队列中，CytoVI揭示了疾病相关的T细胞状态。CytoVI已作为开源软件发布于scvi-tools.org。

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Florian Ingelfinger、Nathan Levy、Can Ergen、Artemy Bakulin、Alexander Becker、Pierre Boyeau、Martin Kim、Diana Ditz、Jan Dirks、Jonas Maaskola、Tobias Wertheimer、Robert Zeiser、Corinne C Widmer、Ido Amit、Nir Yosef

作者机构

Department of Systems Immunology, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel. florian.ingelfinger@uniklinik-freiburg.de.
Department of Internal Medicine I, Medical Center-University of Freiburg, Freiburg, Germany. florian.ingelfinger@uniklinik-freiburg.de.
German Cancer Consortium (DKTK) Partner Site Freiburg, a partnership between DKFZ and Medical Center-University of Freiburg, Heidelberg, Germany. florian.ingelfinger@uniklinik-freiburg.de.
Department of Systems Immunology, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel.
Department of Electrical Engineering and Computer Science, University of California, Berkeley, CA, USA.
Institute of Systems Immunology, Julius-Maximilians-Universität Würzburg, Würzburg, Germany.
Division of Hematology and Laboratory Medicine, University Hospital Basel, Basel, Switzerland.
Department of Internal Medicine I, Medical Center-University of Freiburg, Freiburg, Germany.
Department of Systems Immunology, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel. ido.amit@weizmann.ac.il.
Department of Systems Immunology, Weizmann Institute of Science, Rehovot, Israel. nir.yosef@weizmann.ac.il.
Department of Electrical Engineering and Computer Science, University of California, Berkeley, CA, USA. nir.yosef@weizmann.ac.il.

技术路线

抗体单细胞数据（流式细胞术、质谱流式、CITE-seq） → 统一概率生成模型分析（细胞嵌入生成、缺失测量插补、差异蛋白表达检验、自动细胞注释）

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数据来源：openalex更新时间：2026/10/30 06:02

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临床队列基础研究Nature medicine

EBV reactivation priming of the peripheral immune system in multiple sclerosis relapse.

Devin A King、Shrishti Saxena、Danielle Caefer 等DOI: 10.1038/s41591-026-04665-3

单细胞多组学队列研究

1 次引用趋势数据不足

尽管研究多年，多发性硬化（MS）复发前的细胞与分子事件仍不完全清楚。该观察性研究对复发缓解型MS患者的纵向血样采用单细胞RNA测序、批量转录组学、多参数流式细胞术和靶向病毒逆转录定量PCR，构建了复发前后免疫扰动的时间分辨图谱。单核细胞和B细胞中出现可重复的复发前特征，最早在临床发作前3个月出现，并富集对EB病毒（EBV）裂解再激活因子响应的宿主基因。RT-qPCR证实复发前B细胞中EBV LMP-1转录本升高，流式细胞术显示携带EBV表面蛋白gp350的CD11c+非典型B细胞群体扩增。复发前转录模块与MS全基因组关联研究风险位点及EBNA-2结合增强子重叠，提示遗传易感性与EBV响应程序通过共享调控元件发挥作用。外周激活与中枢神经系统病灶形成的关系尚待明确。

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EBV 感染是 MS 发病基础，但复发启动时序不明；该研究在纵向样本中发现 EBV 裂解再激活提前 2–3 个月出现在外周 B 细胞，与 MS 遗传风险位点协同激活炎症程序，对外周免疫系统预致敏，作为 MS 临床复发的近端前置事件。

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完整作者

Devin A King、Shrishti Saxena、Danielle Caefer、Kyle C Downer、Laura E Saucier、Ethan Goodman、Jonmichael Aracena、Alena Zhirova、Anthilia Alchanat、Saoirse Nolan、Hrishikesh Lokhande、Howard L Weiner、Benjamin E Gewurz、Tanuja Chitnis

作者机构

Translational Neuroimmunology Research Center, Brigham and Women's Hospital, Boston, MA, USA.
Ann Romney Center, Brigham and Women's Hospital, Boston, MA, USA.
Neurosciences Institute, Mass General Brigham, Boston, MA, USA.
Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Brigham Multiple Sclerosis Center, Division of Neuroimmunology, Department of Neurology, Mass General Brigham, Boston, MA, USA.
Division of Infectious Diseases, Department of Medicine, Mass General Brigham, Boston, MA, USA.
Center for Integrated Solutions to Infectious Diseases, Broad Institute, Cambridge, MA, USA.
Translational Neuroimmunology Research Center, Brigham and Women's Hospital, Boston, MA, USA. tchitnis@bwh.harvard.edu.
Ann Romney Center, Brigham and Women's Hospital, Boston, MA, USA. tchitnis@bwh.harvard.edu.
Neurosciences Institute, Mass General Brigham, Boston, MA, USA. tchitnis@bwh.harvard.edu.
Harvard Medical School, Boston, MA, USA. tchitnis@bwh.harvard.edu.
Brigham Multiple Sclerosis Center, Division of Neuroimmunology, Department of Neurology, Mass General Brigham, Boston, MA, USA. tchitnis@bwh.harvard.edu.

技术路线

纵向外周血样本→单细胞RNA测序、bulk转录组、多参数流式细胞术、靶向病毒RT-qPCR→RT-qPCR验证复发前B细胞LMP-1转录本升高，流式验证CD11c+非典型B细胞扩增并表达EBV gp350

最近 5 个完整年度引用趋势

不含 2026 年，仅展示最近 5 个完整年度。

数据来源：openalex更新时间：2026/11/01 03:52

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